会社で会計ソフトを利用して経理データ入力をしています。そのうえで税理士に依頼するメリットはありますか?

専門家のチェックを通して、入力に間違いがないかどうか確認することは有用です。
税理士に依頼していないために、税金を払いすぎているケースもよくあります。
また、税理士に依頼することにより税金や、経営上の相談に乗ることもできます。